组蛋白密码
The `histone code' hypothesis
组蛋白密码定义:组蛋白中被修饰氨基酸的种类、位置和修饰类型被称为组蛋白密码。组蛋白密码的基本元素包括:乙酰化、甲基化、磷酸化、泛素化、糖基化等等。
图中展示了特定位点的组蛋白修饰,其中,部分模式的修饰已经能够与某个生物活动联系在一起(如乙酰化与DNA的转录有关系)。逐渐显露的证据表明,H3(红色)与H4(黑色)的修饰能够分别或者共同作用来调控生命体的活动。多重修饰的层次如何延伸、不同的修饰之间的相互结合如何建立、这种相互结合作用在染色质纤维的特定区域如何维持,这些机制目前还不清楚。图中列举出了与不同的修饰相关的蛋白质或者蛋白质结构域。CENP-A的尾部(蓝色)可能会进行一些与有丝分裂相关的修饰如磷酸化,而黄色部分,其上的丝氨酸、苏氨酸被脯氨酸残基所取代。
Brian D. Strahl ,C. David Allis,nature,2000
遗传密码的表观遗传学延伸,决定了基因表达调控的状态,并且可遗传。
Bryan M. Turner, nature cell biology, 2007
组蛋白多重修饰的酶学
在组蛋白的同一个部位上,在很短的位点上出现了多重的修饰,这时存在一个问题:一个复杂的多重修饰如何能够维持在最开始的位置?进来出现了一个有趣的假说:组蛋白被某一个酶进行共价修饰会影响下一个以该已修饰部位为底物的酶的修饰速率和效率。组蛋白上的修饰靠得足够近以至于能够正向或者负向地影响更深层次的修饰所用的酶的活性。
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